Funzioni e classi di RNA polimerasi

RNA polimerasi nei Eucarioti --> Negli eucarioti, esistono considerevoli differenze tra la trascrizione dei geni per le proteine (RNA polimerasi II) e dei geni per l'RNA (RNA polimerasi I  e RNA polimerasi III).

Elementi dei promotori eucariotici.

Il promotore e' la regione riconosciuta dai fattori di trascrizione piu' comune nei geni codificanti proteine degli eucarioti e' il TATA box, che si trova da -35 a -20 basi a monte del sito di inizio della trascrizione (+1). La sua sequenza consenso, TATAAA, e' abbastanza simile alla regione -10 del sito di riconoscimento del Fattore Sigma 70 dei procarioti. Un altro promotore viene chiamato l'iniziatore (Inr), e presenta una sequenza consenso PyPyAN(T/A)PyPy, ove Py significa pirimidina (C or T), N = qualunque base, e (T/A) significa T oppure A. La base A nella terza posizion si trova nella posizione +1 (il sito di inizio della trascrizione).

Il TATA box  e l'iniziatore sono i "core" promoter elements (regione centrale del promotore). Vi sono altri elementi spesso localizzati entro le 200 bp dal sito di inizio della trascrizione, come il CAAT box ed il GC box che vengono chiamati come elementi prossimali del promotore (promoter-proximal elements).

Le proteine che interagiscono con l'iniziatore ed il TATA box sono chiamate TATA-box binding protein (TBP), perche' il TATA box e' stato il primo iniziatore ad essere identificato. Il TBP riconosce anche il "core" promoter di altri geni codificanti per proteine, ma anche promoters che controllano geni codificanti per RNA (vedi figura). Il TBP e' una subunita' del fattore generale della trascrizione: TFIID. Negli eucarioti, la trascrizione richiede diversi fattori generali della trascrizione ed in molti casi, fattori di trascrizione regolatori.

Articoli di consultazione:

Biological Role of the CCAAT/Enhancer-binding Protein Family of Transcription Factors - J. Biol. Chem., 1998.

C/EBP and the Control of Phosphoenolpyruvate Carboxykinase Gene Transcription in the Liver - J. Biol. Chem., 1998.