CONTROLLO DELLA TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI
 

Enhancers

Gli Enhancers sono degli elementi di regolazione positiva, localizzati sia a monte che a valle del sito di inizio della trascrizione. Tuttavia, la maggior parte di essi sono localizzati a monte. Nei procarioti, gli enhancers sono molto vicini al promotore, mentre negli eucarioti, gli enhancers possono essere localizzati anche molto lontano dal promotore.

Una regione enhancer puo' contenere uno o piu' elementi di riconoscimento per un attivatore trascrizionale.

Esempi di attivatori trascrizionali in mammiferi.

Attivatore
Trascrizionale

Sequenza
Consenso

Attivatore
Trascrizionale

Sequenza
Consenso

AP-1
TGAGTCA
p53
PuGPuCATGPyCPy
*Pu = Purina (A o G);
AP-2
CCC(A/C)N(C/G)3
NF-kB
GGGPuNTPyPyCC
*Py = Pirimidina (C or T);
Oct-1
ATGCAAAT
NFAT
GGAGAPu
*  N = qualunque base.                                                                           
GATA-1
 (A/T)GATAPu
NF-E2
TGACTCAG

*Pu = Purina (A o G); Py = Pirimidina (C or T); N = qualunque base.

Esistoni sequence Cis che agiscono in modo opposto agli enhancers e sono i Silencers (vedi articolo)


Response Elements

Response elements (elementi responsivi) sono le sequenze di riconoscimento di alcuni fattori di trascrizione. Molti di questi sono localizzati entro 1 kb  dal sito di inizio della trascrizione.


Elementi responsivi degli Eucarioti

Elemento responsivo
Fattore di Trascrizione
Sequenza Consenso

CRE
CREB
TGACGTCA
Il cAMP response element (CRE) interagisce con il CREB (CRE-binding protein), che e' regulato dal cAMP (struttura del cAMP) tramite attivazione della Protein Chinasi A.
ERE
Recettore degli Estrogeni
AGGTCANNNTGACCT
Recettore Steroideo
GRE
Recettore dei Glucocorticoidi
AGAACANNNTGTTCT
Recettore Steroideo
HSE
Heat shock factor
GAANNTTCNNGAA

SRE
Serum response factor
CC(A/T)6GG

*(A/T)6 vuol dire sei A o T; N = qualunque base.


link a: CREB-binding Protein (CBP) e  p300 nel controllo della trascrizione

response elementelementi responsivi

Gli Estrogen response element (ERE) ed i glucocorticoid response element (GRE) sono i siti di riconoscimento per il recettore estrogenico ed il recettore dei glucocorticoidi, rispettivamente (figura); entrambi sono fattori di trascrizione attivabili da ligando (l'ormone estrogeno o glucocorticoide) che attivano la trascrizione di geni responsivi a questi due steroidi generando cosi' una risposta biologica allo stimolo ormonale.

Gli Heat shock response element (HSE) sono presenti nei geni codificanti per le heat shock proteins. In risposta a stress esterni alla cellula (es. alta temperatura), gli heat shock factor (HSF)  interagiranno con gli HSE, stimolando l'espressione delle heat shock proteins.

I Serum response element (SRE) legano ai serum response factor (SRF), che possono essere attivati da molti fattori di crescita nel siero. La subunita' Fos di AP-1 e' codificata da un gene che contiene SRE. Fos e' una importantissima proteina regolatoria della progressione del ciclo cellulare.