Enhancers
Gli Enhancers sono degli elementi di regolazione positiva, localizzati sia a monte che a valle del sito di inizio della trascrizione. Tuttavia, la maggior parte di essi sono localizzati a monte. Nei procarioti, gli enhancers sono molto vicini al promotore, mentre negli eucarioti, gli enhancers possono essere localizzati anche molto lontano dal promotore.
Una regione enhancer puo' contenere uno o piu' elementi di riconoscimento per un attivatore trascrizionale.
Esempi di attivatori trascrizionali in mammiferi.
| Attivatore Trascrizionale |
Sequenza Consenso |
Attivatore Trascrizionale |
Sequenza Consenso |
|
|
AP-1 |
TGAGTCA |
p53 |
PuGPuCATGPyCPy |
*Pu = Purina (A o G); |
| AP-2 |
CCC(A/C)N(C/G)3 |
NF-kB |
GGGPuNTPyPyCC |
*Py = Pirimidina (C or T); |
|
Oct-1 |
ATGCAAAT |
NFAT |
GGAGAPu |
* N = qualunque base. |
|
GATA-1 |
(A/T)GATAPu |
NF-E2 |
TGACTCAG |
*Pu = Purina (A o G); Py = Pirimidina
(C or T); N = qualunque base.
Esistoni sequence Cis che agiscono
in modo opposto agli enhancers e sono i Silencers (vedi articolo)
Response Elements
Response elements (elementi responsivi) sono le sequenze di riconoscimento di alcuni fattori di trascrizione. Molti di questi sono localizzati entro 1 kb dal sito di inizio della trascrizione.
Elementi responsivi degli Eucarioti
| Elemento responsivo |
Fattore di Trascrizione |
Sequenza Consenso |
|
| CRE |
CREB |
TGACGTCA |
Il cAMP response element (CRE) interagisce con il CREB (CRE-binding
protein), che e' regulato dal cAMP (struttura
del cAMP) tramite attivazione della Protein Chinasi A. |
| ERE |
Recettore
degli Estrogeni |
AGGTCANNNTGACCT |
Recettore
Steroideo |
| GRE |
Recettore
dei Glucocorticoidi |
AGAACANNNTGTTCT |
Recettore
Steroideo |
| HSE |
Heat
shock factor |
GAANNTTCNNGAA |
|
| SRE |
Serum
response factor |
CC(A/T)6GG |
*(A/T)6 vuol dire sei A o T; N = qualunque base. |
link a: CREB-binding Protein
(CBP) e p300 nel controllo della trascrizione
response element = elementi responsivi
Gli Estrogen response element (ERE) ed i glucocorticoid response element (GRE) sono i siti di riconoscimento per il recettore estrogenico ed il recettore dei glucocorticoidi, rispettivamente (figura); entrambi sono fattori di trascrizione attivabili da ligando (l'ormone estrogeno o glucocorticoide) che attivano la trascrizione di geni responsivi a questi due steroidi generando cosi' una risposta biologica allo stimolo ormonale.
Gli Heat shock response element (HSE) sono presenti nei geni codificanti per le heat shock proteins. In risposta a stress esterni alla cellula (es. alta temperatura), gli heat shock factor (HSF) interagiranno con gli HSE, stimolando l'espressione delle heat shock proteins.
I Serum response element (SRE) legano ai serum response factor (SRF), che possono essere attivati da molti fattori di crescita nel siero. La subunita' Fos di AP-1 e' codificata da un gene che contiene SRE. Fos e' una importantissima proteina regolatoria della progressione del ciclo cellulare.