Select a marker

Hi15b02
Primer features
Name Sequence Length Tm  
Hi15b02.F TATGGTGGCAACAGTGGAGA 20 nt 58.4 °C Primer Stats
Hi15b02.R GTTTCGCCACCTCCACTTAACATC 24 nt 65.2 °C
SSR info
SSR repeat type Imperfect
Locus type single locus
Detected loci
Alleles size range 196-202
Number of alleles detected 4
Expected heterozygosity n.d.
PCR annealing temp 60
Sequenced allele size 0
Linkage group(s)
Developed by HiDRAS consortium
Other maps Fiesta-3
Reference publication Silfverberg-Dilworth E, Matasci C L, Van de Weg W E, Van Kaauwen M P W,Walser M, Kodde L P, Soglio V, Gianfranceschi L, Durel C E, Costa F, Yamamoto T, Koller B, Gessler C, Patocchi A (2006) Microsatellite markers spanning the apple (Malus x domestica Borkh) genome. Tree Genetics & Genomes 2(4): 202-224
Remarks clean, compl. band(s)
Sequence
>Hi15b02 TTGTGATGGTGGTGGTGGTGATGGTTGTGATGGTGATGATGGTAGGTGGTGACTATGGTG GCAACAGTGGAGATGATGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGACAATGGTAATGGT AGGTGGCGGTGAGGGTGATGATAGTGGGTGGTGACAGCAATGATGGTAAGTGGTGGTGGC AGCGGTGATGGTGGATGGTGCGTTGTGGTGGTGGCAGTGGTGATGATGTTAAGTGGAGGT GGCGGCATCGATGGTGATGGTGGATGGTGGATGGTGGATGGAGGTGGCGGTGGAAGTCGT GGTGGTGGCAGTGGTGGTGGTGAAGGTAGATGATGGTGGTGGTGATGGTGATGATGGTAG GCACCNTTGGCNCTGANNCCNNAATTCCNAATCNCNANTTCNGGATCCNANNCNNNNCNC NNNNGCNNNNTGCNNGNNNCCNANCTTTCCCNNNNNNGANNCNNANNNNANCNNGNNNNN NNCNNNGNCNNNNCNGNNNCCNGNGNNNNNNNGNNNNCCNCNCCNNNNNNCCNNNNNNCN NNNNNNCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNGNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNN NNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
User's notes
THERE ARE NO USER'S NOTES.
Allele size and gel image
Cultivar Allele size
Fiesta
Discovery
Gala
Florina
Nova Easygro
TN10-8
Durello di Forli
Prima
Modial Gala
Fuji
196
196:199
199
202
null
202

199

202


admin Send comments to Luca Gianfranceschi